David Ellinghaus, Ph.D., Frauke Degenhardt, M.Sc., Luis Bujanda, M.D., Ph.D., Maria Buti, M.D., Ph.D., Agustín Albillos, M.D., Ph.D., Pietro Invernizzi, M.D., Ph.D., Javier Fernández, M.D., Ph.D., Daniele Prati, M.D., Guido Baselli, Ph.D., Rosanna Asselta, Ph.D., Marit M. Grimsrud, M.D., Chiara Milani, Ph.D., et al., for The Severe Covid-19 GWAS Group*
Abstract
Background. Vi è una notevole variazione nel comportamento della malattia tra i pazienti infetti da sindrome respiratoria acuta grave coronavirus 2 (SARS-CoV-2), il virus che causa la malattia coronavirus 2019 (Covid-19). L’analisi dell’associazione Genomewide può consentire l’identificazione di potenziali fattori genetici coinvolti nello sviluppo di Covid-19.
Metodi. Abbiamo condotto uno studio di associazione su tutto il genoma che ha coinvolto 1980 pazienti con Covid-19 con malattia grave (definita come insufficienza respiratoria) in sette ospedali negli epicentri italiani e spagnoli della pandemia di SARS-CoV-2 in Europa. Dopo il controllo di qualità e l’esclusione dei valori anomali della popolazione, 835 pazienti e 1255 partecipanti al controllo dall’Italia e 775 pazienti e 950 partecipanti al controllo dalla Spagna sono stati inclusi nell’analisi finale. In totale, abbiamo analizzato 8.582.968 polimorfismi a singolo nucleotide e condotto una meta-analisi dei due pannelli caso-controllo.
Risultati. Abbiamo rilevato associazioni di replicazione incrociata con rs11385942 nel locus 3p21.31 e con rs657152 nel locus 9q34.2, che erano significativi a livello del genomewide (P <5 × 10−8) nella meta-analisi dei due pannelli di controllo dei casi (odds ratio, 1,77; intervallo di confidenza al 95% [CI], 1,48 a 2,11; P = 1,15 × 10−10; e odds ratio, 1,32; IC al 95%, 1,20 a 1,47; P = 4,95 × 10−8, rispettivamente) . Nel locus 3p21.31, il segnale di associazione attraversava i geni SLC6A20, LZTFL1, CCR9, FYCO1, CXCR6 e XCR1. Il segnale di associazione nel locus 9q34.2 coincideva con il locus del gruppo sanguigno ABO; in questa coorte, un’analisi specifica per gruppo sanguigno ha mostrato un rischio più elevato nel gruppo sanguigno A rispetto ad altri gruppi sanguigni (odds ratio, 1,45; IC 95%, 1,20-1,75; P = 1,48 × 10−4) e un effetto protettivo nel gruppo sanguigno O rispetto ad altri gruppi sanguigni (odds ratio, 0,65; IC al 95%, da 0,53 a 0,79; P = 1,06 × 10−5).
Conclusioni. Abbiamo identificato un cluster di geni 3p21.31 come un locus di suscettibilità genetica in pazienti con Covid-19 con insufficienza respiratoria e confermato un potenziale coinvolgimento del sistema dei gruppi sanguigni ABO. (Finanziato da Stein Erik Hagen e altri.)
